Тэг: стоимость анализа

Действительно, наиболее доступная модификация MALDI масс-спектрометра Bruker Microflex LT/SH примерно в три раза дороже автоматического бактериологического анализатора. Однако детальный экономический анализ системы MALDI Biotyper демонстрирует более высокую рентабельность метода в сравнении с бак.анализаторами.

Даже если рассматривать исключительно экономическую составляющую метода, очевидно, что MALDI Biotyper имеет преимущество перед бак. анализатором. Выгода от использования MALDI Biotyper становится наиболее очевидной при наличии лабораторного потока от 300-500 анализов в неделю.  Ключевым фактором является стоимость реагентов  для масс-спектрометрической идентификации МО, которые в 50-100 раз (!) дешевле по сравнению наборами для бактериологических анализаторов. Таким образом, с каждым последующим анализом экономическая выгода становится все более очевидной. Окупаемость анализатора Microflex LT при потоке около 500 анализов в неделю составляет один год. Это позволяет в дальнейшем значительно сэкономить на реагентной базе в последующие периоды.

Но, безусловно, методические выгоды от использования MALDI Biotyper превосходят экономические. Производительность лаборатории при использовании метода значительно возрастает. Появляется возможность увеличения пиковой нагрузки лаборатории до 1500 идентификаций в день (прибор затрачивает всего 30-40 минут на идентификацию 95 образцов МО).

MALDI Biotyper изменяет саму культуру работы в бактериологической лаборатории. Исследователю становится доступно использование уже первичного посева для идентификации МО, без необходимости дополнительно пересева и ожидания лишних суток роста. Прямая идентификация положительных гемокультур позволяет на сутки раньше начать лечение больных с сепсисом. Дополнительные базы по мицелиальным грибам и микобактериям позволяют точно идентифицировать традиционно сложные для анализа микроорганизмы. Лаборанту становится доступна возможность анализа смесей из двух разнородовых культур.

Безусловным достоинством метода является высокая точность самой идентификации, сравнимая с секвенированием последовательности 16S рРНК.

Ниже приводим обобщенные сравнительные характеристики работы с бак.анализатором и MALDI Biotyper

 Таблица 1. Сравнительная характеристика эффективность использования масс-спектрометра с системой MALDI Biotyper и автоматического бак.анализатора

Низкая себестоимость анализа достигается путем простого протокола прободготовки.

Метод предусматривает нанесение материала из единичной колонии микроорганизма. Из реактивов для анализа используются только раствор «матрицы» для масс-спектрометрии (раствор α-циано-4-гидроксикоричной кислоты или HCCA).

Для одного анализа потребуется 1 мкл матричного раствора в концентрации 10 мг НССА/мл. Таким образом, фирменной упаковки НССА, содержащей 1 грамм вещества хватит на 100 тысяч анализов. Это соответствует стоимости около одного рубля (!) на образец, с учетом стоимости растворителя.

Для увеличения достоверности анализа системы Biotyper используется «калибровочный бактериальный стандарт». Стандарт представляет собой смесь белков E.coli DH5α, с добавлением двух белков крупной массы. Калибровка происходит в рабочем диапазоне масс. Стандарт необходимо вносить в одну из 96 точек на мишени, что соответствует доли в 4 рублей от стоимости единичного анализа.

Таким образом, стоимость реагентов для прямой MALDI идентификации составляет около 5 рублей (!) за одну идентификацию.

Остальная стоимость анализа складывается из простого лабораторного пластика, такого как одноразовые петли и типсы для дозаторов. 

Еще раз отметим, что в масс-спектрометрах Bruker используется МНОГОРАЗОВАЯ стальная мишень (чип), которая НЕ ЯВЛЯЕТСЯ расходным материалом.

Не секрет, что существуют близкие приборы, использующие одноразовые стеклянные подложки в качестве MALDI мишеней. Такой подход значительно увеличивает себестоимость анализа, не улучшая его достоверности или качества.