Тэг: MALDI

На чем основан принцип метода MALDI Biotyper?

MALDI Biotyper– программно-аппаратный комплекс, предназначенный для быстрой идентификации микроорганизмов с использованием MALDI-ToF масс-спектрометров серии FLEX производства Bruker (например, Microflex, Autoflex ).

 

Метод выявляет уникальный набор белков исследуемых микроорганизмов – своеобразный «отпечаток пальца». Идентификация микроорганизма происходит в основном по рибосомальным белкам, которые встречаются во всех микроорганизмах.

 

Биоинформационная модель, основанная на анализе белков, позволяет надёжно и точно проводить идентификацию конкретного микроорганизма до вида путём сопоставления получаемых масс-спектров белков с обширной базой данных. На начало 2018 года база Biotyper составляет более 2700 видов микроорганизмов.

Объясните в двух словах: что делает масс-спектрометр?

Как следует из названия – масс-спектрометр прибор, измеряющий массу вещества. Проще говоря, масс-спектрометр это очень точные и чувствительные весы, способные «взвешивать» различные молекулы, в частности, пептиды, белки, нуклеиновые и жирные кислоты.

 

Для того чтобы провести масс-спектрометрический анализ («взвешивание»), необходимо получить ионы (заряженные частицы) исследуемого вещества. MALDI - (МАЛДИ, матрично активированная лазерная десорбция и ионизация) – один из способов такой ионизации вещества. Он наилучшим образом подходит для исследования крупных био-полимеров, таких как белки.

 

Ниже приведено формальное определение: Масс-спектрометрия (MS) — метод исследования массы (или соотношения массы к заряду [m/z]) вещества посредством специальных воздействий электрических и магнитных полей на исследуемое вещество в ионизированной форме

Что такое MALDI-ToF? Это такой бренд?

Понятие масс-спектрометрии включает в себя достаточно большую группу приборов, основанных на различных принципах ионизации и разделения ионов вещества в полях, необходимых для получения масс-спектра.

Поскольку белки, пептиды, нуклеиновые кислоты являются тяжелыми полимерами со сложной структурой, то существуют определенные требования к ионизации и разделению биомолекул в полях:

 

–Сохранение целостности молекул при ионизации

Эффективное разделение ионов биомолекул в полях

–Ионизация должна носить предсказуемый характер

–Простая пробоподготовка

–Простая интерпретация данных 

 

Из множества вариантов получения и разделения ионов MALDI-ToF масс-спектрометры наилучшими образом отвечают заявленным характеристикам.

 

Для указания типа используемого метода в названии прибора приводится своеобразная классификация масс-спектрометрии, указыващая на метод ионизации и метод разделения ионов.

 

Таким образом, MALDI-ToF подразумевает собой прибор, где и используется:

  • MALDI или МАЛДИ - Матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация – система получения ионов из твердой фазы. Это метод «мягкой» ионизации сухого вещества,  обусловленный воздействием лазерного излучения на смесь матрицы с анализируемым веществом.
  • ToF – время-пролетный метод разделения ионов в вакууме (измерение скорости дрейфа частиц в специальной трубе)