Как уже было сказано, пробоподготовка для масс-спектрометрического анализа проста.
Лаборанту лишь нужно нанести колонию с чашки на мишень и добавить раствор матрицы. Для этой процедуры необходимы только петли и дозатор позволяющий добавлять 2мкл с соответствующими наконечниками.
Для облегчения и ускорения повседневной работы, мы рекомендуем использовать электронный дозатор с функцией многократной порционной выдачи объема 1-2 мкл.
Для максимально увеличения сроком хранения, HCCA матрица поставляется в исследовательскую лабораторию в виде сухого кристаллического порошка. Лаборанту необходимо один раз в 1-2 недели приготовить раствор матрицы. Процедура требует наличия набора дозаторов соответствующего объема и миницентрифуга-вортекс.
Факультативно, для соблюдения точности протокола мы также рекомендуем использовать аналитические весы с точностью до 0.1 мг для дозировки кристаллической матрицы. Отвес кристаллов удобнее производить тонким химическим шпателем.
В некоторых случаях (около 5% от всей работы) исследователю понадобится провести процедуру дополнительной экстракции белков из колонии микроорганизмов. Процедура проста и занимает не более 15-20 минут. Для этого потребуется наличие лабораторной центрифуги на 12 000 g для микропробирок 1.5 мкл.
По окончании работы с системой MALDI Biotyper, лаборанту потребуется помыть стальную мишень с нанесенными образцами. Для удобства выполнения этой процедуры мы рекомендуем иметь стальную или стеклянную емкость диаметром ~100 мм и высотой ~50 мм
Общий список дополнительного оборудования выглядит следующим образом:
|
Оборудование |
Рекомендуемый производитель |
|
Центрифуга для микропробирок 12000g |
Microspin 12, SIA Biosan или аналог |
|
Миницентрифуга-Вортекс |
MSC-3000, SIA Biosan или аналог |
|
Аналитические весы с точностью не менее 0.1 мг |
Sartorius TE64, или аналог |
|
Механический дозатор объемом от 0.2 мкл |
Дозатор mLINE 0.1-3 мкл, Biohit, или аналог |
|
Механический дозатор объемом до 20 мкл |
Дозатор mLINE 2-20 мкл, Biohit, или аналог |
|
Механический дозатор объемом до 100 мкл |
Дозатор mLINE 20-200 мкл, Biohit, или аналог |
|
Механический дозатор объемом до 1000 мкл |
Дозатор mLINE 100-1000 мкл , Biohit, или аналог |
|
Электронный дозатор, имеющий шаг 0,2-2 мкл |
Дозатор eLINE 0.2-10 мкл, Biohit, или аналог |
|
Металический шпатель для точного забора порошков из пробирок |
Шпатель двухсторонний микро, лопатка 40х3 мм, длина 150 мм, нержавеющая сталь, Bochem |
|
Химический стакан, 250 мл |
любого производителя |
|
Стеклянный или металлический резервуар для чистки мишеней MALDI (Ø ~100 мм, высота ~50 мм) |
любого производителя |
|
Штатив-рабочее место для 1.5 мл и 0.2 мл пробирок |
любого производителя |